对于“内丹”，他解释，简单来说，“内丹”就是一个高能量的气团 。中医领域中讲人的真气，“内丹”就是真气组成的一个团，能量比较高 。

“此次实验结合了最先进的核磁共振技术，目前全国只有这一台(核磁共振系统)，价格超过200万 。”孔令宏此前接受媒体采访时表示，为了把这台仪器运到华家池校区，费了很大功夫 。
孔令宏的同事、浙大人文学院哲学系教授李恒威也曾对相关话题有过关注，他告诉澎湃新闻，西方哲学家、心理学家、认知神经科学家对东方“心学”(包括宋明理学、儒道思想)的研究并不陌生，在19世纪末便有了面对面的议题对话 。

李恒威说，目前来看，最充实、有效、有影响力的议题研究出现在超个人心理学、神经科学与东方佛教传统(如禅宗、密宗、唯识学、南传佛教等)之间，并且已经有一些成果发表 。
较近的一次研究成果，是2015年发表于《细胞》杂志的一篇题为《重建和解构自我：冥想练习中的认知机制》的文章，由威斯康星大学麦迪逊分校理查德 戴维(Richard J.Davidson)、法国国家健康和医疗中心研究人员安托万 卢茨(Antoine Lutz)等一同署名，他们都是冥想科学领域的带头人 。
上述实验开始于2000年，15年间，100多名佛教人士，以及大量冥想初学者参与了威斯康星大学麦迪逊分校等大学的科学实验 。
通过对比资深冥想者、初学者和非冥想者的大脑扫描，研究者发现冥想带给人们脑部的变化——大脑某些区域的体积会变大 。科学家们基于这一结果开始解释为何冥想有可能增强人们的认知能力，并带来情感上的好处 。
上述研究认为，特定的冥想机制有治疗不良自我体验(抑郁症、疼痛)以及提高幸福感的可能性 。

报名者修为高低如何衡量？
支持者表示，国外对于佛教禅定的研究已经开展多年，国内也应该进行类似的研究，学术研究就应包罗万象 。

美国威斯康星大学是这方面的前驱：该校麦迪逊分校研究团队从2000年开始对佛教禅定冥想机制进行神经科学的研究，发现冥想会使得大脑某些区域的体积变大，并科学地解释了冥想有可能增强人们的认知能力，并带来情感上的好处 。这项成果2015年发表于《细胞》杂志 。
反对者则认为，“内丹修炼”是神秘主义行为，登堂入室成了高等学府的研究对象，颇有些不可思议 。
陕西省社科院宗教研究员潘存娟向澎湃新闻解释，目前学界对于内丹的研究大多在典籍研究上，涉及到具体修炼的并不多，从大的方向上来说，道教的修炼讲究“外在能量的摄取和内在精神的升华”，“外在的摄取就是通过吃(丹药)，内在的精神升华可能与佛教禅定颇有类似” 。
一位不愿具名的医生对澎湃新闻说，一些道教人士结庐炼丹，伴有汞、铅等影响人体健康的重金属摄入，“在神经科学介入之前，先从消化科学研究起吧” 。
孔令宏的实验能否将内丹的修炼与外丹的摄入隔离开呢？
多名相关学者认为，可能修炼者在外丹和内丹上各有侧重，但是根据道教典籍所言，大部分是同时进行的 。

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